硕博培养打通：按一级学科制定培养方案。以资源共享为原则，除少数交叉学科、语言类、艺术类学科外，在一级学科基础上制定研究生培养方案。改变硕博士培养方案截然分开的做法，硕士期间修读课程在博士阶段可以申请免修。打破学院、学科之间部门所有制造成的封闭状态，实现优质资源共享和学科交叉融合。全校研究生培养方案个数压缩了81%，按一级学科制定的培养方案从21个增加到51个，硕博贯通的培养案达48个，硕博课程全部共享的学院从3个增加至17个。

  硕博学制打通：严格博士生中期考核制度。实施研究生弹性学制，学术型博士生学制由3年延长为4年。逐步完善博士生招生“申请考核制”，推行“硕博连读”制度，多渠道改善博士生生源结构。允许硕士阶段提出硕博连读的申请，形成硕博连读1+4、2+4、3+4的多种模式。从2014级（首批实施新培养方案）博士生开始，按照“先行先试、边改革边完善”原则，实施博士生中期考核，进行中期考核分流与淘汰，严格研究生教育过程管理。

  国内国际培养打通：加快推进研究生培养国际化。加强与世界一流大学合作交流，相继与加拿大麦吉尔大学、美国辛辛那提大学、特拉华大学、南安普敦大学、澳大利亚麦考瑞大学等高水平大学签署合作培养博士研究生协议，鼓励学生申请国家公派出国留学。设立博士生出国访学和学术交流基金，资助博士生前往国外高水平大学开展访学交流，资助博士生出国出境参加高水平国际学术会议；打造国际暑期学校，利用“第三学期”每年邀请近百位外国专家学者在短学期开设研究生课程和讲座。

  培养过程与科学研究融合：实施博士生培养科研配套经费制度。突显研究生的培养“研究”色彩，把博士生招生计划分配与导师科研项目适当挂钩，使更多博士生流向承担科研项目较多的导师，引导教师和研究生面向国家重大需求和经济建设的主战场开展研究。改变传统一对一作坊式的培养方式，在理工科引入导师组制度。同时，在化学化工学院和公共卫生学院进行实验室轮转制探索，打破导师之间的门户壁垒，鼓励学生在不同导师和实验室轮转开展研究和学习，使不同的科研训练贯穿于培养过程。

  课程教学与科研训练融合：优化研究生课程教学体系。改变因人设课，减少课程教学学分，增设体现科研训练的学术报告、中期考核、实习实践和预答辩等培养环节学分；提高选修课比例，改变以课堂教学为主的模式，为学生参加科研提供更多时间和空间；规范课程管理，按一级学科统一课程质量标准，建立课程开课准入机制和开课竞争机制，所有新开课都必须通过一级学科培养指导委会评估、审核。经过改革，研究生课程总数从4000余门减少为1900余门，精简了一半以上，必修课比重从44%降至25%。

  课内学习与课外创新创业融合：鼓励研究生开展原创性科研。设立“研究生田野调查基金”等各类科研创新基金项目，鼓励学生走进社会，开展原创性科学研究。鼓励学生开展课外创新创业，举办“海峡两岸口笔译大赛”、“厦门大学‘毕马威杯’管理案例分析全国十强邀请赛”等多个学术竞赛，组织全国研究生数学建模大赛、未来飞行器大赛、电子设计大赛、移动终端、智慧城市等多个全国性比赛。资助研究生开展实践活动，资助100余支研究生队伍赴全国各地开展实习实践。